新 生物信息学 为 Linux

Jmol 是一个开源，跨平台和免费的图形软件，最初设计用作3D化学结构的分子查看器。它以四种独立模式运行，如HTML5...

Orthanc是一个完全免费的，开源的，简单，重量轻，但功能强大的REST风格的独立DICOM（医学数字成像和通信医学）服务器，可以在医疗保健和医学研究的环境中使用。这和rsquo的;用C...

Ghemical是在GNU GPL下发布的计算化学软件。这意味着，包完整的源代码可用，并且用户可以自由地研究和修改程序包。 Ghemical是用C ++编写。Ghemical项目具有图形用户界面（这是基于GNOME），并且支持量子力学（半经验和从头）模型和分子力学模型（还有一个实验荣誉学位5.2样力场有机molecu也为减少蛋白质的模型[1]的一个工具是包括在内。几何优化，分子动力学和一大组的可视化工具目前已经上市。Ghemical依靠外部码以提供量子力学计算。半经验方法MNDO，MINDO /...

SyntenyMiner是一个应用程序可视化和查询多个完整的基因组序列之间的比较。该接口提供匹配的通航，以便参考基因组序列。序列之间的匹配不同基因组染色体可以进一步审查的散点图的背景下，揭示大型和小型规模的基因组rearragements包括倒置，插入/缺失，易位和...

mpiBLAST是一个基于MPI并行实现NCBI BLAST的。该项目包括的一对替代FORMATDB和blastall与执行BLAST作业并行安装了MPI的计算机集群上的版本方案。有两个主要的优势，使用mpiBLAST与传统的BLAST。首先，mpiBLAST分割在每个节点的数据库集群中。因为数据库的每个节点的段是较小它通常可以驻留在缓冲区缓存，得到显著加速由于消除的磁盘I /...

RFLP策划者是一个工具，帮助规划一个RFLP实验：它发现的限制酶，切断了一套以不同的方式同源的DNA序列，并模拟所产生的凝胶 -...

阿敦项目是一个可扩展的生物分子模拟程序，包括数据管理和分析能力。阿敦提供先进的算法和协议，可以从一个直观的用户界面，但也从一个更灵活的方案一级来访问分子模拟。它是建立在阿敦框架，它是一个功能强大的库，用于创建和操纵模拟。然而，它通过将用于分析和模拟的数据的管理工具藏汉作为提供机构，其允许容易扩展其能力超越只是进行模拟。在许多意义阿敦很简单，就是可以将任何分子模拟工具，使得它几乎是无限的增长潜力的结构。阿敦是一个新的可扩展的分子模拟程序，还包括数据管理和分析能力。以下是我们对1.0版本的软件主要目标的概述。目...

GDIS是一个基于GTK程序的显示和操作分离分子和周期性系统。这个软件是在发展，但仍然是相当的功能。这里是“GDIS”的一些主要特点：...

生物信息学标杆体系是要建立一个合理的测试框架，测试和数据，以使最终用户和厂商探讨他们的系统的性能的一种尝试。我们现在要做的是创建一个用于测试的框架，以及测试核心组都可以下载并使用探测系统性能的具体内容。此外，源头上这些测试是根据GPL提供，并托管在Bioinformatics.org和可扩展的情报有限责任公司的想法是，以使最终用户，消费者，系统开发商，和其他人轻松地构建和使用的测量和调整的原因有意义的测试。乔兰德曼从可扩展的情报LLC构思的想法，并写了原来的代码。我们正在寻找更多的基准码建议，测试，数据集等...

pyNetConv是为了帮助一些网络文件格式转换一个Python库。自从0.6版本，pyNetConv能够读/写（和转换/于）以下文件格式：...