Open Babel

软件截图:
Open Babel
软件详细信息:
版本: 2.3.2
上传日期: 17 Feb 15
许可: 免费
人气: 58

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

打开通天塔是一个开源的,已被设计作为一种化学工具箱特别设计的以识别化学数据的众多语言协作,自由和多平台库软件。它被简单地称为“开放化学工具箱”的。在一个glanceWith打开巴别特征时,用户将能够搜索,分析,转换,以及从化学,分子建模,生物化学,以及其他相关领域存储数据。它支持多种常见的化学文件格式,包括MOL2,SDF / MOL,PDB,XYZ,SMILES,和CML。
此外,打开通天提供了一个全功能的程序员的工具包,化工MIME支持,SMARTS匹配,灵活的原子/债券打字员,氢删除和添加,位向量类,矩阵,向量转换,以及分子测试suite.Under引擎盖和支持的操作系统systemsOpen巴贝尔在C ++语言编写的。它&rsquo的;支持GNU / Linux的,BSD,的Solaris,SGI,微软Windows和Mac OS X操作系统的SA真正的跨平台软件。 32位和64位计算机是在写作的时候this.Getting开始与所有开放BabelFirst正式支持,我们强烈建议您使用预编译的二进制包,从默认的软件仓库安装打开通天您Linux发行版。如果您的GNU / Linux系统没有按&rsquo的;吨在其回购打开通天塔软​​件,那么你&rsquo的;将不得不编译和安装使用提供Softoware存档中的普遍来源的应用程序。
将压缩包下载(tar.gz压缩),将其解压缩到您选择的位置,打开一个终端仿真器,定位到解压的文件夹,并执行与ldquo; cmake的”的命令(不带引号)配置项目。然后,你必须运行“让”的命令,不包括引号,当然,编译它。请确保在之前的上述指示安装在您的操作系统的CMake的工具

什么在此版本中是新的

  • 在这个版本是一个重大的错误修复释放,应该是一个稳定的升级,强烈建议开启通天塔的所有用户。很多bug和改进已经在去年以来的2.3.0版本中增加的。

什么是2.2.2版本,新的

  • 在这个版本是一个重大的错误修复释放是一个稳定的升级,强烈建议开启通天塔的所有用户。虽然可能没有很多新的功能,很多死机等错误已得到修复,因为2.2.1。
  • 在升级到新的InChI 1.02版本,生产标准化InChI和InChIKey输出。
  • 在读/写时SMILES修正许多立体的错误。这是将在2.3版本中完成了一个更大的项目的一部分。
  • 在固定的编译和安装在Cygwin和MinGW平台。
  • 在显着改善芳香和凯库勒债券分配。
  • 在改进2D - >三维坐标生成
  • 在改进使用--gen3d命令行操作坐标生成
  • 在性能提升的坐标生成。
  • 新--fillUC的命令行操作巴贝尔。
  • 修正了pH依赖型加氢。
  • 新增支持从莫尔登,MOLPRO和NWChem读取振动数据输出文件。
  • 从最近的理论计算更新原子半径。
  • 修正了当读取gzip压缩MOL2或XML文件。

  • 错误后
  • 在关闭文件。修复了Pybel一个错​​误的地方文件将照常开放。
  • 还有更多的bug修复和小功能改进。 ==新的文件格式==进出口:
  • 在MOLPRO输入和输出。
  • 在VASP协调文件(CONTCAR和POSCAR)。

什么是2.2.1版本,新的

  • 在改进脚本接口,包括Python 3的支持和改进Java和C#的支持。
  • 在增加了对MACCS指纹支持。感谢RDKit项目。
  • 在许多修复和增强力场代码。特别是UFF力场实现应该处理更多的分子。
  • 在改进的3D坐标生成,尤其是环片段。你可以给这与obgen工具一试。
  • 修正了各种PDB导入错误与原子类型。
  • 在增加了阅读收费和半径从PQR文件格式的支持。
  • 在增加了读写单元细胞PDB格式的支持。
  • 最新及QUOT;输出"采取通用&QUOT文件格式; .OUT"," .LOG"和" .DAT"文件和读取基于内容相应的文件类型。目前运作非常良好的量子化学包。
  • 新增改进的错误处理和报告当无法加载文件格式。
  • 在改进CIF文件格式的支持。
  • 在很多,很多,很多额外的bug修复和小的改进。

类似的软件

ISLEC
ISLEC

20 Feb 15

PyVib2
PyVib2

2 Jun 15

Kalzium
Kalzium

20 Feb 15

GAMGI
GAMGI

22 Jun 18

显影剂的其他软件 Geoff Hutchison

ChemSpotlight
ChemSpotlight

13 Dec 14

Avogadro2
Avogadro2

22 Nov 14

意见 Open Babel

评论没有发现
添加评论
打开图片!