Swiss-PdbViewer

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Swiss-PdbViewer
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版本: 4.0.1
上传日期: 3 Jan 15
许可: 免费
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Rating: 3.5/5 (Total Votes: 2)

瑞PdbViewer(又名DeepView)是提供一个友好的用户界面,允许分析几种蛋白质在同一时间的应用程序。蛋白质可以叠加以推断结构比对和比较它们的活性位点或任何其它相关的部件。氨基酸突变,氢键,角度和原子之间的距离很容易就可以得到由于直观的图形和菜单界面。

瑞士PdbViewer(又名DeepView)已自1994年以来developped由Nicolas Guex。瑞士PdbViewer是紧密相连的SWISS-MODEL,瑞士生物信息学研究所(SIB)的结构生物信息学组在Biozentrum在巴塞尔内开发的自动化同源建模服务器。

使用这两种方案大大降低了工作的需要产生模式,因为这可能对线程的蛋白质一级序列到一个3D模板,​​并获得了如何很好的螺纹蛋白质将立即反馈量提交建立失踪循环和完善侧链包装的要求之前,由参考结构所接受。

瑞士PdbViewer还可以阅读电子密度图,并提供各种工具来构建成密度。此外,各种建模工具是可以产生用于流行能量最小化封装集成和命令文件。

最后,作为一个特殊的奖金,POV-Ray的场景可以从目前来看,为了使惊人的光线跟踪质量的图像生成的。

什么是新的本新闻稿中:

  • 在胸腺嘧啶C6原子是现在正确加载
  • 修正了POV-Ray的输出无尽的PC版本循环
  • 偶尔的崩溃,同时节省PDB文件(如2i37)在PC上已修复
  • 更新乌普萨拉电子密度地图服务器的地址

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