MacMolPlt是一个化学的可视化工具,它可用于具有集成图形模型构建器构建的分子,创建输入文件为GAMESS计算化学程序,然后可视计算化学运行的结果。其特点包括高品质的3D显示器,正常模式和反应序列和输出各种格式,包括高品质的图像和QuickTime和Flash动画动画。
- 在输入使用:
- 在MolPlt文件格式冲出了GAMESS
- 通过粘贴在任何GAMESS或高斯笛卡尔坐标日志文件
- 在任何GAMESS输入,记录或IRC文件
- Xmol风格XYZ文件
- 莫尔登格式的文件
- 在蛋白质数据银行(PDB )文件
- 化学标记语言(CML)的文件
- 有一个互动的分子编辑
- 生成图形化使用笛卡尔或Z-矩阵式的内部坐标,手工打造
- 在结构和普通模式
- 在普通模式下的动画3D显示。
- 3D实时旋转和平移下鼠标控制
- 在任何Z-matrix参数的计算
- 在可视化的措施/显示器的距离,角度和二面角。
- 线性运动最少(LLM)路径自动创建
- 2D和3D计算和显示:
- 在分子轨道(AO的,MO的,或LMO的)
- 在电子总密度
- 密度差异
- 分子静电势(MEPMaps)
- 在为GAMESS基本输入文件生成器
- 用于高品质的3D渲染
- 支持分子对称性
- 在生成对称的依赖原子
- 确定对称独特的原子
- 自动确定一组坐标点支式组的列表。
- 在坐标旋转到正确的方向原则
- 显示对称性运营商的许多点群
- 在出版质量的输出(彩色或黑白),通过直接打印或复制并粘贴到另一个应用程序。
- 输出的各种形式,包括Windows位图,JPEG,PNG,CML,XMol XYZ,MDL molfile,POV-Ray的,Flash动画和QuickTime影片。
什么在此版本中是新的:
若干改进已到显示的代码。选项已被添加到prefernces的3D窗格用于平滑着色有和没有阴影。
增加了对MOPAC文件的基本支持。
增加的选择切换从头开始,MM,和EFP原子的知名度。
改进的型号核心潜力的支持。
增加了一个钩输入建设者新GAMESSQ程序。
提高了PDB文件分析器。
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