拟南芥Motif的扫描仪(AMS)是在本地计算机上运行的Windows应用程序。它的开发通过识别在模型植物拟南芥顺式调节元件的位置,并通过提供一个简单的接口,以评估基因的关系,以建立基因网络。其主要创新特点是顺式调控元件结合的位置,NGS和DNA芯片阵列表达数据,拟南芥的注释和转录因子调控基因网络的鉴定基因的相互作用。在专注于转录因子的功能研究,软件使用的表达数据,并在调节基因区结合位点的图案来预测的直接靶基因。此外,AMS利用DNA-蛋白质和proteinprotein交互数据,以促进由感兴趣转录因子调节的代谢途径的鉴定。
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