misopy

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misopy
软件详细信息:
版本: 0.4.9
上传日期: 20 Feb 15
开发: Yarden Katz
许可: 免费
人气: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO(异构体的混合物)是用Python编写的概率框架,进行定量的表达水平与NBSP;从RNA测序数据的选择性剪接基因,并确定整个样本差异调节亚型或外显子。
通过模拟的生成过程,其中读取来自于RNA测序亚型的生产,从MISO模型使用贝叶斯推断来计算该读出来自一个特定同种型的概率。
MISO使用的读操作亚型定量底层一套替代mRNA异构体的丰度的推断分配。置信区间过度估计可以得到的,其量化所述估计值的可靠性。
请参阅http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/的MISO手动和文档

要求

  • 在Python中

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