PANAMA

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PANAMA
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版本: 0.57
上传日期: 14 Apr 15
许可: 免费
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PANAMA是一种新型的概率模型来解释混杂因素eQTL研究,用Python编写的。
隐混杂因素,诸如未观测协变量或未知细微环境扰动可以创建伪假协会或掩盖真实遗传关联的信号。相较于以前的方法,巴拿马学习隐性因素与遗传凸显监管机构的共同作用。其结果是,这种新的模型能够更加准确地分辨混淆变异真实遗传关联的信号。
N.副食,哦。 Stegle和ND劳伦斯,“混杂因素和突出的遗传监管机构的联合建模提供更高的精度在遗传基因组学研究”,公共科学图书馆计算生物学,2012
更多信息以http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

  • Python

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