SeedWaterSegmenter

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SeedWaterSegmenter
软件详细信息:
版本: 0.5.5.0
上传日期: 20 Feb 15
许可: 免费
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SeedWaterSegmenter是一个图形的Python工具以交互段的细胞在组织中具有边缘的标签的图像堆栈&NBSP(又名白色轮廓。);该相互作用完全是基于种子的编辑,而这又是一个分水岭膨胀算法。 SWS和其他工具的主要区别是,你可以把每个细胞,它可以帮助你调整难度细胞的界限多个种子。
SWS是建立在顶级的wxPython的,matplotlib,numpy的,SciPy的,和mahotas。
在它的核心,它采用了闪电般快速的分水岭算法(感谢mahotas项目),并允许实时更新。它有一个简单(如杂乱)UI,是完全互动的,甚至包括1级撤消。
关于SWS公布,让所有这些细节,更在术A部分:
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cyto.a.22034/​​abstract
源代码被镜像到四个仓库和的PyPI:
- GitHub上:http://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/
- 到位桶:http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegmenter
- Gitorious:http://gitorious.org/seedwatersegmenter
- 谷歌代码:http://code.google.com/p/seedwater/
- PyPI中:http://pypi.python.org/pypi/SeedWaterSegmenter
在谷歌代码页也有一些二进制版本(http://code.google.com/p/seedwater/)应该工作在32位Windows或64位Linux的,但这些都是现在老了。现在请使用“easy_install的”方法。
有关详细信息,请参阅Python的安装说明20XX.txt您可能还需要阅读的手册:SeedWater分段V XX Manual.txt
安装和运行
安装终于容易!
事实上,你现在可以“easy_install的SeedWaterSegmenter”
快速说明:
Windows / Mac的:
 安装Enthought Python发行http://www.enthought.com/products/edudownload.php
Ubuntu的/ Debian的:
 命令和apt-get安装的python-setuptools的蟒蛇,蟒蛇wxtools-numpy的蟒蛇,蟒蛇SciPy的-matplotlib蟒蛇成像的python-xlrd蟒蛇,xlwt
在一个cmd窗口或终端(苹果/ Linux)的(必须是在Windows Vista / 7管理员身份运行),运行:
  easy_install的mahotas cmpGen EllipseFitter FilenameSort GifTiffLoader ImageContour SeedWaterSegmenter
详细说明:
最新的版本被称为:
“Python的安装说明八月2012.txt”
https://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/blob/master/Python安装说明八月2012.txt

要求

    < LI>的Python

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