QuasiRecomb 1.0

QuasiRecomb是运行在命令控制台,模拟马尔可夫模型生成病毒准种的轻量级应用程序。它描述了病毒准种和一种方法的产生,通过分析下一代测序数据来推断其参数。模型验证对模拟数据,示出的显式服用重组过程考虑在内的优点,并且通过对读取从实验HIV样本获得的涂敷试验。它提供了EM算法的实现找到模型参数,并估计病毒株在准种的分布方法的最大后验估计 要求:...