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ProteinShop是用于操纵蛋白质结构的交互式工具。它被设计用来快速创建使用人类的知识和直觉一组蛋白质配置。这些配置可以进行局部或全局优化。虽然ProteinShop
不进行全局优化过程本身，它提供了一个
框架可用于与一个全局优化过程互动
这可能是一个远程计算机上运行。
ProteinShop提出了三种级别的功能
Ⅰ级：显示一个三维的蛋白质结构
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