Cytoscape的是用于可视化的分子相互作用网络和生物学途径和整合这些网络与注解,基因表达谱,和其他状态数据的开放源码的生物信息学软件平台。虽然Cytoscape的最初设计用于生物研究,现在它是复杂的网络分析和可视化的一个通用平台。 Cytoscape的核心分布提供了一组基本的功能,数据集成和可视化。附加功能可作为插件。插件可用于网络和分子分析分析,新的布局,更多的文件格式的支持,脚本,并与数据库的连接。插件可以通过使用基于Java技术和插件社区发展是鼓励Cytoscape的开放API的人得到发展。 ...

DNA Baser

DNA Baser 3.5.4

易于使用对齐软件进行DNA序列组装,重叠群编辑,以及Windows突变检测。它是分子生物学软件,可以在重叠群查看和组装序列。产品特点:年底夹子,出口序列,组件,代码检测。脱氧核糖核酸卑劣是用于DNA序列的组件重叠群的产生一个廉价的替代。支持的文件格式是ABI,SCF和seq(或FASTA)。功能结束夹,出口和汽车装饰。...

FlexNovo

FlexNovo 1.6.3

FlexNovo是基于所述FLEXX技术的增量构成的配位体中的活性位点的新的分子设计程序。它有利于一个片段为基础的方法从头设计中靶的三维结构的情况下。它意味着是一个集成的和用户定制的理念生成系统。它表明新的结构基序,设计铅原型库,并且在提出新颖支架以及替代结合模式为靶蛋白。它也有利于在活性位点的深度的配位体的演变,如果一个启动。该软件可以是即使有专业知识结合起来,例如,考虑到与目标键相互作用,特定的化学基序,或某些物理化学性质更加强大。...

PoseView

PoseView 1.1.2

PoseView一个紧凑的工具,其能够通过提供结构数据作为原始PDB文件,以产生二维图表。该输入可以直接来自晶体结构,或由一个对接程序计算,例如。输出可以可视化在一GUI或出口到PNG-,PDF-或XFIG文件。...

SketchEl

SketchEl 1.56

SketchEl是一个互动的化学分子素描工具和分子电子表格数据录入应用程序。通过分子绘提供的功能集主要限于方便编辑的小分子结构图表示法所需的最小特征。工具栏,模板,鼠标手势,键盘快捷键,实用程序命令,和几个视图模式,以使这个尽可能的方便提供。分子可以容易地互变与无处不MDL MOL文件格式。分子图被在高质量交互呈现,并且也可以被导出为SVG图形。 。SketchEl的新数据表功能允许查看和简单的数据表,为此,每列是一种常见的标量型或分子编辑 要求: < P> Java...

SASfit

SASfit 0.93.4

SASfit是专为您提供程序拟合结构模型,以小角散射数据的简单,方便,而且非常易于使用的应用。它可以计算就像回转半径,散射不变,并Porod恒整体结构参数。它可以容纳大小分布连同若干形式的因素,包括不同的结构因素。另外的算法已被实施,它允许同时适应几种散射曲线与一个共同的参数集。全局拟合有助于明确确定哪通过分析单个曲线会否则强烈相关拟合参数。...

QuasiRecomb是运行在命令控制台,模拟马尔可夫模型生成病毒准种的轻量级应用程序。它描述了病毒准种和一种方法的产生,通过分析下一代测序数据来推断其参数。模型验证对模拟数据,示出的显式服用重组过程考虑在内的优点,并且通过对读取从实验HIV样本获得的涂敷试验。它提供了EM算法的实现找到模型参数,并估计病毒株在准种的分布方法的最大后验估计 要求:...