FlexNovo

FlexNovo 1.6.3

FlexNovo是基于所述FLEXX技术的增量构成的配位体中的活性位点的新的分子设计程序。它有利于一个片段为基础的方法从头设计中靶的三维结构的情况下。它意味着是一个集成的和用户定制的理念生成系统。它表明新的结构基序,设计铅原型库,并且在提出新颖支架以及替代结合模式为靶蛋白。它也有利于在活性位点的深度的配位体的演变,如果一个启动。该软件可以是即使有专业知识结合起来,例如,考虑到与目标键相互作用,特定的化学基序,或某些物理化学性质更加强大。...

PoseView

PoseView 1.1.2

PoseView一个紧凑的工具,其能够通过提供结构数据作为原始PDB文件,以产生二维图表。该输入可以直接来自晶体结构,或由一个对接程序计算,例如。输出可以可视化在一GUI或出口到PNG-,PDF-或XFIG文件。...

FlexS

FlexS 2.1.2

FlexS预测相对于另一个的配位体中的一个的构象和取向。在FlexS基准配体被假设为刚性的,因此,它应该在的构象,它类似于结合状态进行说明。在FlexS叠加算法只需要很少的人工干预。您可以通过手动进行单步整合这方面的知识到计算与FlexS。因此,FlexS设计用于配位体对,以及用于配位体为基础的虚拟筛选的交互工作。 FlexS的两个主要应用是配体超定位(如:为的CoMFA / QSAR)和虚拟筛选。如果你有一个蛋白和小分子结合到它(所谓的引用 -...