挖洞轮车定位仪(BWA)是对齐针对长期参考序列比较短的碱基序列,例如,人类基因组的高效程序。该软件实现了两个算法,BWA-短期和BWA-SW。前者作品查询序列比200bp的短,达到约100kbp后者为更长的序列。两种算法做跳空对齐。它们通常更精确和更快的具有低错误率的查询。请参阅BWA手册页了解更多信息。 BWA是否对齐454读取? 是的,没有。 BWA的BWA-SW部分运作良好,在454读取约200个基点以上。它实现了类似的对准精度来SSAHA2而快得多。...