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全基因组表达谱提供了不同条件下的细胞的全局状态的快照。然而,mRNA水平不提供直接的了解上游监管机制。 Expression2Kinases(X2K)是一种新的方法来确定上游监管机构可能负责在全基因组基因表达观测到的变化。通过集成芯片起/芯片及位置重矩阵器(PWM)数据,蛋白质 - 蛋白质相互作用,并且激酶底物磷酸化反应X2K可用于识别调节机制中的基因表达的全基因组差异上游。我们的想法是第一推断调节基因表达的差异的最可能的转录因子,然后使用蛋白 - 蛋白相互作用来连接使用额外的蛋白质所识别的转录因子构建集中于这些因素的转录调节子网络,最后使用的激酶底物蛋白磷酸化反应,以确定和秩候选蛋白激酶,最有可能调节所识别的转录复合物的形成。 X2K还包含工具来执行基因列表富集分析和预测药物可以逆转或加重基因表达的变化。该X2K方法可以促进我们的细胞信号传导的理解和解开作用机制的药物
要求:
的Java Runtime Environment 6.0
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