R

R是一个开源的，免费分发和多平台的命令行软件，提供了一个集成套件的软件设施，可以很容易地用于数据计算，处理和图形显示。换言之，R是一种编程语言和环境用于统计计算和图形。
它＆rsquo的; SA GNU项目类似，由约翰·钱伯斯和他的同事在贝尔实验室，这是以前被称为AT＆T，现在朗讯科技创建了S编程语言和开发环境。它配备了全面的文档可以在该项目＆rsquo的; S homepage.Features在glanceKey功能包括一个有效的，发达的，简单的编程语言，有用的数据存储和处理功能，一组数组的计算，尤其是矩阵运营商，一个连贯的，大的和集成的中间的实用程序进行数据分析，以及图形功能的数据显示和分析。
它可以很容易地扩展更多的功能，配备了多种图形和统计技术，包括线性和非线性建模，时间序列分析，聚类，分类和经典的统计测试。 R能够用于生产出版物品质图，包括数学公式和符号。
此外，用户将能够链接并调用C ++，C和Fortran代码在运行时，通过指定新的功能添加额外的功能，遵循所做的算法选择，以及操作读直接通过编写C代码的对象。其内置的插件架构允许您轻松通过packages.Under扩展其默认功能的发动机罩和支持OSesR是可用于在各种GNU / Linux和UNIX类操作系统的跨平台的命令行应用程序系统，包括BSD，以及对Microsoft Windows和Mac OS X.它在C编程语言实现，并已在32位和64位硬件平台测试成功。

<强>什么在此版本中是新的：

• 在新的特点：
• 的embedFonts（）现在默认格式=＆QUOT; ps2write＆QUOT;为.PS和的.eps文件。这是Ghostscript 9.x中可用（自2010年），而以前的默认格式=＆QUOT; pswrite＆QUOT;，辗转于Ghostscript的9.10
• 对于[dpqr]规范（），[DP] lnorm（sdlog = 0）模拟一个质点在EXP（mulog），而不是返回NaN（一个错误）的一致性。
• 在功能（）现在报告，如果ICU被编译为用于整理（它实际上只使用如果有合适的区域设置为整理，从不为C语言环境）。

加载如果链接对CRAN基于X11的Tcl / Tk，如果这样的Tcl / Tk的组件和X11库安装在
• （OS X只）包装tcltk检查。这样就可以得到更多的信息错误信息通知XQuartz的缺失组件或安装。
• 的X11（）设备和数据编辑器和查看器的基于X11的版本检查（通过编辑（）和视图（）从命令行R数据帧和矩阵调用）的X11库安装，如果没有建议安装XQuartz。
• 在icuSetCollat​​e（）允许区域=＆QUOT;默认＆QUOT;，和语言环境=＆QUOT;没有＆QUOT;使用OS服务，而不是为ICU整理。
• 环境变量R_ICU_LOCALE可以用来设置默认的ICU区域设置，在的情况下一个来自OS的语言环境衍生不合适（这是目前需要在Windows上）。
• 新功能icuGetCollat​​e（）在使用上的ICU归类区域报告（如果有的话）。
• 在utils的::进行urlencode（）进行了更新，而不是RFC 1738使用毫无保留的和保留的字符RFC 3986，，。
• 在唯一（警告（））和c（警告（））现在支持。
• 在使用setRepositories的Bioconductor的'版本'（）现在默认为3.0。 （它可以被设置在运行时_via_环境变量R_BIOC_VERSION。）
• 在安装附带的软件：
• configure脚本上不会被编译更重要的功能/选项报告。
• 在更多类型的外部BLAS是由名在该报告的认可​​。
• 在构建时为r共享库中，-L $ {} R_HOME / lib目录$ {} R_ARCH标志前面放置在安装过程中使用的链接命令和软件包安装的时候：这有助于确保当前构建具有优先权如果的R共享库已经安装了如在LDFLAGS提到库安装，溴化锂（而不是'你的系统的库目录“的文件）。 （祝PR＃15790。）
• 在乳胶包upquote不再需要对R的使用inconsolata的。
• （仅Windows）如果安装了32位和64位版本的R，垃圾桶/ R.exe和斌/ Rscript.exe可执行文件已现在运行64位R.（运行32位R，覆盖这些文件的副本与斌/ I386 / Rfe.exe。）
的
• 实用工具：
• 在运行R CMD请与_R_CHECK_DEPENDS_ONLY_真正使得现在即使他们列在暗示VignetteBuilder封装，因为它们需要识别和处理非Sweave护身符。
• 在R CMD检查现在报告空importFrom声明命名空间中的文件，因为这些都是常见的错误（写importFrom（PKG），其中进口（PKG）之意）。
• 在R CMD现在检查默认情况下，检查代码的使用直接在包装上没有空间装载和附加包和建议，提高。对于在现场：建议包装好的做法，看英语写作R附加软件'SS1.1.3.1。在封装自己的代码使用延迟数据对象，看到了吗？数据。
• 在BUG修正：
• 在dmultinom（）没有正确处理非有限概率。
• 在prettyNum（X，zero.print = *）现在也工作在x包含港定居。
• 在由nlminb（）在Windows上展出了长期的bug被曝在GCC 4.6.3编译器的bug;一种解决方法已到位。 （PR＃15244和PR＃15914）。
• 在帮助页面的HTML版本命令呈现已得到改进：这是特别明显的帮助页面上安装
• 在as.hexmode（x）和as.octmode（X）现在可以正确行为的一些数字X，例如，c（NA，1）或c（1，PI）。
• 在drop1（），如果失败的范围参数没有变量下降。 （PR＃15935）
• 编辑（）（因此修正（））失败，如果一个对象有一个非字符属性命名为＆QUOT;源＆QUOT; （已被前2.14.0版使用R中的一个属性）。
• 在callGeneric（）可能会失败，如果通用有...作为一个正式的说法。 （PR＃15937）。
• 在分叉的包被称为并联在Child C级入口点退出。这是不安全的（_exit应该被称为），并可能刷新主要研发过程（看到最常在Solaris上）的标准输入。
• 在作为好的做法，标准输出分叉现在孩子才刷新。
• 研究对象，如列表（`A B` = 1）现在可以正确打印。
• 在getAnywhere（＆QUOT; C_pbinom＆QUOT;）现在返回正确的单个对象（而不是unlisting吧）
。
• 在该confint（）方法NLS（）千篇一律未能就这些已指定的参数限制，尽管使用的算法比＆QUOT等;港口＆QUOT ;. （PR＃15960）
• 在通过其初始化子类，如果类所需参数的发电机发生故障，一个S4级（）方法。
• 在removeSource（）没有正确处理包含参数表达式提供了失踪，如X [我]。 （PR＃15957）
• 在as.environment（列表（））现在工作，和这样的环境as.list（）现在是一样的列表（）。
• 在一些tcltk功能在不寻常的环境中运行时失败。 （PR＃15970）
• 选项（列表（））现在工作（平凡）。 （PR＃15979）
• 在合并（......）现在可以正常工作了两个独立的`“树状图（PR＃15648），而且还兼容通过调整=＆QUOT;汽车＆QUOT;例如在现有的系统树的两个分支。
• 在该地块的方法和QUOT; hclust＆QUOT;对象得到一个可选的参数检查;如果这是真的（默认值）将检查更仔细的有效输入。
• （仅Windows）如果用户选择安装64位R，但不是32位R，垃圾桶/ R和斌/ RSCRIPT可执行文件无法运行。 （PR＃15981）
• 在各种可能的缓冲区溢出是可以避免的，而错过内存保护增加。 （PR＃15990）
• 在RSCRIPT不再通过--args至R时，有没有额外的（＆QUOT;用户QUOT;）。参数
• 在喜欢的getClass对象（＆QUOT; refClass＆QUOT;）@原型现在打印（）和STR（）没有错误
。
• 在相同的（）现在也着眼于S4位。
• HIST（X，时间）是在加入小起毛至几个场所更加健壮当一些非常大。 （PR＃15988）
• 在子（）和GSUB（）没有处理像＆QUOT正则表达式; S {2}＆QUOT;正确如果文本包含NA或非ASCII元素在UTF-8语言环境。这部分是由于在TRE库中的错误。 （PR＃16009）
• 在RShowDoc（＆QUOT; NEWS＆QUOT;）现在显示的PDF版本
。
• 在矩阵和阵列最后一维零并未在所有或不完全打印。 （PR＃16012）
• 在plot.histogram（），因此HIST（）现在尊重xaxs，yaxs和实验室图形参数。 （PR＃16021）
• 在bw.SJ（x）和其它体重。*（）不再段错误当X包含非有限值。 （PR＃16024）
• 在R CMD Rd2pdf无意间忽视了它--oS选项。
• 在download.file（）是不是在文件大于2GB（从libxml2的继承）大报告的文件大小和进步正确的内部方法。这被校正为64位版本（32位平台可能不支持这样的文件，但在可能的情况将R中的未来版本的支持）。
• 在各地OS X约塞米蒂一个bug，其中关键的环境变量可以被复制导致子进程问题的工作。重复的，现在R上启动时（通过Rprofile）去除。 （PR＃16042）
• 在调整X11自动启动检测显示在OS X识别最新XQuartz。

什么是3.0.2版本，新的：

• 在新的特点：
• 在新闻文件已被重新组织。
• 在该文件包含R＆GT的消息; = 3.0.0：对于0.xy，1.xy和2.xy发布消息是在文件NEWS.0，NEWS.1和NEWS.2。安装R当后者的文件现已安装。新闻的HTML版本从2.10.0到2.15.3可以作为DOC / HTML / NEWS.2.html。
• 在总和（）的整数参数，现在至少使用64位的整数蓄电池等都将在累计总和超过2 ^ 53的非常罕见的情况下（不一定相加超过400万元）更准确。
• 的示例（）和工具:: Rd2ex（）函数现在有参数以允许它们忽略 dontrun标记中的例子。 （彼得Solymos建议。）
• 在STR（x）是相当快的非常大的列表，或因素与10万级，后者在PR＃15337。
• 在col2rgb（）现在转换因素字符串不是整数代码（由布赖恩·汉森建议）。
• 在尾部（警告（））现在工作，通过新的`[`方法。
• 在目前人们对于LaTeX的样式文件zi4.sty其中有一些发行取代inconsolata.sty支持。
• 在不公开的（X）现在通常返回所有非列表XS不变，而不仅仅是＆QUOT;向量'的。因此，格式（LST）现在也工作在名单LST具有非向量元素。
• 在该工具:: getVignetteInfo（）函数中增加了提供有关安装护身符的信息。
• 在新assertCondition（）等公用事业的工具，用于测试。
• 在剖析目前记录从字节编译代码，内建函数的非内联调用。
• 在使用非标准的评价现在更谨慎地遵循命名空间作用域规则的统计信息和其他各种功能。例如统计:: LM（）现在可以找到统计:: model.frame（），即使统计数据是不是在搜索路径，或如果一些包定义名称的功能。
• 如果无效/损坏.Random.seed对象在工作区中遇到它忽略了警告，而不是让一个错误。 （这使得R自身是依靠工作RNG，比如选择一个随机端口。）
• 在SEQ（）和seq.int（）给出更明确的错误信息，如果调用无效（如NaN）的投入。
• 当解析（）发现一个语法错误，这使得现在可到错误的位置，部分解析信息。 （请Reijo桑德的。）
• 在由NextMethod调用的方法（）有不同的动态父通用。这是造成麻烦的地方，通过懒惰的评价调用S3方法可能会失去跟踪他们的共通的。 （PR＃15267）
• 为负二项分布代码现在对待的情况下大小== 0作为零一分的分布情况。
• 缩写（）处理无预警的非ASCII字符串输入的不需要的缩写。
• 在read.dcf（）不再有每行8191字节的限制。 （祝PR＃15250。）
• formatC（x）的不再拷贝类x的该结果，以避免误用创建无效对象中的PR＃15303。警告给出如果一个类被丢弃。
• 在数据集NPK已经从MASS复制到允许在不安装推荐的软件包来运行更多的测试。
• 在有马非退化差分模型（）已经被改变，并在一些实施例中的回归系数的初始化避免了局部最大值。 （PR＃15396）
• 在termplot（）现在有一个说法transform.x控制在剧情个别条款的显示。 （PR＃15329）
• 在格式（）现在支持数字= 0，显示nsmall小数。
• 有一个新的只读杆（）参数称为QUOT;网页＆QUOT;，它返回一个逻辑值，表示下一plot.new（）调用是否将启动新页
• 在处理Sweave和Rd为PDF文件，现在呈现反引号和单引号更好地在一些情况下，包括在代码 SAMP表情。
• utils的:: modifyList（）得到一个新的参数keep.null允许空部件，在更换被保留，而不是引起相应的部件将被删除，。
• 在工具:: pkgVignettes（）获得的参数检查;如果设置为TRUE，这时会出现一个小插曲请求不存在暗角发动机警告。
• 实用工具：
• 在R CMD检查--as-CRAN检查线宽在包Rd文件的使用和示例部分。
• 在R CMD检查--as-CRAN现在意味着--timings。
• 在R CMD检查查找命令GFILE如果没有找到合适的文件。 （尽管文件不是从GNU，OpenCSW在Solaris上安装它作为GFILE。）
• 在R CMD建立（与内部焦油）检查的配置和清理文件的访问权限，并添加如果需要执行权限的权限，记录这些文件，并发出警告。这是对操作系统和文件系统不支持执行权限（值得注意的是，在Windows上）非常有用。
• 在R CMD现在建​​编织和缠结所有护身符，不包安装过程中，如果源码包准备与当前的R CMD构建必需的，这样建议的软件包。
• 在checkFF（）（使用R CMD检查）做的检测，从其他软件包，包括不报那些功能已经从另一个命名空间复制调用一个更好的工作（例如，作为一个默认的方法）。现在报告呼吁在哪里.NAME是在另一个包中注册的象征。
• 在类Unix系统一样，R CMD立即安装安装包组writably每当库（lib.loc）是组可写的。因此，u​​pdate.packages（）适用于其他小组成员（原建议，并从一个补丁德克Eddelbuettel）。
• 在R CMD javareconf现在支持在具有真实路径平台使用符号链接JAVA_HOME。因此，现在有可能使用
• 在R CMD javareconf JAVA_HOME = / usr / lib目录/ JVM / Java为1.7.0
• 在Linux系统上，并记录该值，而不是作为/usr/lib/jvm/java-1.7.0-openjdk-1.7.0.25.x86_64的频繁变化的完整路径等。
• （仅Windows）。RSCRIPT -e需要与Unix版本R.一致性一个非空的参数（也R项-e和R -e。）
• 在R CMD检查确实宣布包和命名空间的更彻底的检查。据报道
• 在封装在一个以上的对Depends，进口申报，顾名思义，增强了描述文件的各个领域。
• 在进口申报，但不从，无论是在空间文件也使用::也不:::运营商导入的命名空间。

这是用来在库（）或要求（）在R代码调用，但已经把_via_取决于搜索路径
• 的包。
• 在Depends中声明的包不导入_via_空间文件（除标准封装）。从Depends中包使用的对象应导入，以避免冲突，并让正确的操作空间被加载，但没有连接的时候。
• 在物体进口_via_ :::电话::哪里会做。
• 在由::这不导出导入的对象。
• 在对象由:::进口调用不存在的。
• 在良好做法，请参阅“写作R附加软件'。
• 在R CMD检查可选检查非标准顶层的文件和目录（这往往是错误）：这是启用--as-CRAN
• LaTeX的样式文件upquote.sty不再包含（该版本是几个岁）：它不再是在一个R.使用很久以后的版本通常包含在LaTeX的分布，但不与AE字体踢好这是默认的Sweave护身符。
• 在R CMD构建更有用包源的构建子目录，例如以记录有关的小插曲的信息。
• 在安装附带的软件：
• 在用于Texinfo手册宏已更改为与texinfo的5.x中所做的不兼容的变化更好的工作。
• 的最低版本的系统XZ库现在是5.0.3（是4.999）。这部分是为了避免5.0.2，它可以在压缩方式的其他版本不能解压缩。
• 在PCRE所包含的版本已经更新到8.33。
• 在zlib的所包含的版本已经更新到1.2.8，一个bug修复版本。
• 在XZ utils的的liblzma所包含的版本已经更新到5.0.5。
• 由于javareconf（见上文）被安装R当被使用时，可以提供用于JAVA_HOME一个稳定的连接，就
• 在与--disable字节编译将覆盖推荐的软件包，这通常需要字节编译的描述文件配置。
• 更多的安装和检查过程，即使当设置了TMPDIR含有空格的路径，但不推荐这样做与外部软件（如TEXI2DVI）可能无法将工作。
• 在软件包安装：
• 在安装被立即中止，如果没有安装LinkingTo包。
• 在R CMD INSTALL有一个新的选项--no字节的编译，将覆盖在包的描述文件ByteCompile场。
• 在BSD许可不赞成使用：使用BSD_3_clause或BSD_2_clause而不是
• 在许可X11已经过时：使用MIT或BSD_2_clause而不是

是
• 的LinkingTo包版本要求目前公认：他们在安装进行检查。 （场的版本要求以前忽略。）
• 在一个空间文件500 S3method项的限制已取消。
• 在Bioconductor的默认'版本'为其包已更改为即将到来的2.13，但可以通过环境变量R_BIOC_VERSION，例如设置在文件Renviron.site。
• 在C-LEVEL设施：
• 在Rdefines.h已经调整了，因此它可以被包含在C ++代码之后R_ext / Boolean.h（其中包括由RH）。
• 注意Rdefines.h没有跟上最新的，并且Rinternals.h是首选的新代码。
• 评估applyClosure现在免受封装代码提供了无效的RHO。
• 在废弃了，倒闭的：
• 在未使用的空间参数package.skeleton（）现在已经正式弃用，并将在研发3.1.0被删除。
• 在plclust（）已过时：使用地块（）方法类和QUOT; hclust＆QUOT;代替。
• 在功能封装工具readNEWS（）和checkNEWS（）已过时（他们还没有与当前新闻的文件很长一段时间）。
• 文档：
• 在“概论R'对基于R作为脚本语言包括与操作系统交互的新的篇章。
• 在BUG修正：
• 在help.request（）无法确定的R CRAN上的当前版本。 （PR＃15241）
• 在Windows中，file.info（）失败的根目录，除非路径被终止明确＆QUOT;＆QUOT ;. （PR＃15302）
• 在该regmatches 1.（草案邓拉普，PR＃15386）。
• 茎（）现在放弃无穷的投入，而不是挂。 （PR＃15376）
• 解析器现在强制C99语法浮点十六进制常数（例如0x1.1p0），而不是对错误常数返回意想不到的值。 （PR＃15234）
• 在model.matrix（）现在工作很长的LHS名（超过500字节）。 （PR＃15377）
• 在集成（）恢复到前2.12.0行为：从2.12.0至3.0.1有时未能达到要求的宽容和报道均超过了误差估计。 （PR＃15219）
• 在strptime（）现在处理％的W值为0（PR＃15915）
领域
• 研究现在更好的保护，以防止人们试图在启动代码的控制台交互。 （PR＃15325）
• 在子集一维数组经常丢失dimnames（PR＃15301）。
• 在逻辑向量一元+并没有强制成整数，但一元 - 做
• na.omit（）和na.exclude（）加一个行到零行数据帧。 （PR＃15399）
• 在所有（在必要删节）护身符安装在R配置了--without推荐-包。
• 在源（）报告语法错误时不显示文件名。
• 在语法错误报告错位插入符指出不好的令牌。
• （仅适用于Windows）开始R 3与R（而不是R项或Rgui）将失去在命令行参数的任何零长度字符串。 （PR＃15406）
• 在通过--encoding = foo中的命令行上指定的编码错误不妥善处理。 （PR＃15405）
• 如果x是一个符号，is.vector（x，＆QUOT;名称＆QUOT;）现在，返回true，因为＆QUOT;名称＆QUOT;和＆QUOT;符号＆QUOT;应该是同义词。 （由Herv'e Pag`es报道。）
• 在R CMD rtags与XSI兼容shell命令回声的平台上的作品（如OS X）。 （PR＃15231）

如记录（而非NA）
• 在is.unsorted（NA）返回false。
• 在R CMD LINK不知道子架构。
• 在系统（）和系统2（）是更好的保护，防止用户谁misguidedly在临时目录路径中使用空格。
• 在file.show（）和编辑（）现在更有可能工作在包含空格的文件路径。 （如果外部实用程序使用，不规范的Windows也不R.app应以前工作过。）
• 使用方法封装包更容易时，他们将其导入工作，但它没有连接。 （它的C代码的几个部分要找的搜索路径，而不是它的名称空间其研发的功能。）
• 在lgamma函数（-x）不再NaN的非常小x。
• （视窗）系统2（）现在尊重，如果所谓的从Rgui指定输出和错误的文件。 （PR＃15393）
• 在关闭的X11（）设备，而定位器（）或标识（）过程中不再挂起R.（PR＃15253）
• 在list.dirs（full.names = FALSE）没有落实。 （PR＃15170）
• 在格式（）有时会添加不必要的空格。 （PR＃15411）
• 在all.equal（check.names = FALSE）将忽略忽略名称的要求，并会检查他们的属性。
• 在通过工具:: Rd2txt_options设置的符号（itemBullet =）不尊重在某些地区。 （PR＃15435）
• 在mcMap（）没有被包并行输出。 （PR＃15439）
• 在图（）为TukeyHSD对象没有平衡dev.hold（）和dev.flush（）调用多页的地块。 （PR＃15449）

什么是2.8.1版本，新的：

• 在这是一个维护版本，并修复了一些大多是小错误和平台问题。