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Pathomx是基于工作流的工具，用于实验数据的分析和可视化。最初创建作为用于代谢数据分析工具已扩展，现在可以用于任何科学和非科学的数据分析。
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该软件的功能和工作流程的混合基于脚本的方法来分析。使用工作流是可能的构造的快速的，可重复的分析构建体为实验数据。通过使用自定义脚本内嵌组合这能够执行任何分析可想而知。工作流可以动态地重新安排，以测试不同的方法和保存到跟踪方法的发展。保存工作流还可以与其他用户或组，允许即时重放的结果和方法的共享。工具可以导出图像中常见的格式发布就绪高清晰度的图像。
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