SAVI Signaling Analysis and Visualization

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SAVI Signaling Analysis and Visualization
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查看的蛋白质 - 蛋白质和配体 - 蛋白质相互作用的曲线图(网络),其中的生物分子被表示为节点和它们之间的相互作用被表示为链路,是一种有前途的方法用于集成不同来源的实验结果来实现的分子机制系统了解驾驶细胞表型。大规模的信令网络的出现提供了一种拓扑统计分析的机会,而这种网络的可视化提出了挑战。 SAVI实现标准方法来计算聚类,连接分布和检测,以及可视化,网络图案。此外,SAVI产生的网络数据集以文本格式完整的网站。 SAVI包含一个名为PathwayGenerator工具。此工具创建的连接地图从描述细胞信号转导的相互作用大表的网页。 SAVI还可以从基因/蛋白名字列出网络

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