的主轴的是基于核糖体RNA（rRNA）的基因区域的长度生物识别的另一种方法。在一般情况下，来自不同物种的初级rRNA基因序列的比对显示核苷酸养护和变异的交替区域，无论是在核苷酸取代的术语（通常称为“单核苷酸多态性”）和插入/缺失（INDEL）事件。的插入和缺失的结果在不同长度的序列的存在，并引入缺口的对准，通常表示为短划线“ - ”。
我们对生物识别概念使用rRNA基因序列如下：保守区域用于定义可变片段（“主轴的高变区”），其中序列的组合长度是每个物种（一个“主轴的轮廓”）的特征。因此，每个物种可以通过一个唯一的数字信息进行定义。
从理论上讲，只有6每20个等位基因（或11个地区，每个5个等位基因）高变区的调查，就足以区分所有真核物种在地球上，这估计是5至15万元的数目。在实践中，主轴的是能够与低种内变异和高亲缘分辨率鉴别真核物种的93.3％。
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