Arabidopsis Motif Scanner 2.0

拟南芥Motif的扫描仪（AMS）是在本地计算机上运行的Windows应用程序。它的开发通过识别在模型植物拟南芥顺式调节元件的位置，并通过提供一个简单的接口，以评估基因的关系，以建立基因网络。其主要创新特点是顺式调控元件结合的位置，NGS和DNA芯片阵列表达数据，拟南芥的注释和转录因子调控基因网络的鉴定基因的相互作用。在专注于转录因子的功能研究，软件使用的表达数据，并在调节基因区结合位点的图案来预测的直接靶基因。此外，AMS利用DNA-蛋白质和proteinprotein交互数据，以促进由感兴趣转录因子调节...