FlexS预测相对于另一个的配位体中的一个的构象和取向。在FlexS基准配体被假设为刚性的,因此,它应该在的构象,它类似于结合状态进行说明。在FlexS叠加算法只需要很少的人工干预。您可以通过手动进行单步整合这方面的知识到计算与FlexS。因此,FlexS设计用于配位体对,以及用于配位体为基础的虚拟筛选的交互工作。 FlexS的两个主要应用是配体超定位(如:为的CoMFA / QSAR)和虚拟筛选。如果你有一个蛋白和小分子结合到它(所谓的引用 - 配体),但蛋白质的结构没有,你可以采取参考结构的活性位点的负指纹。 FlexS通过对准它们决定了测试和参考结构之间的相似性。在虚拟筛选,你有一个参考配体和一组化合物和你感兴趣的化合物进行实验测试优先。
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