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命令行工具使用的相对差异，确定最相似的构象进行比较以逗号分隔的数据文件。 Compsort使用相对差比较的数据文件，计算相似性得分，按升序排列的得分（较低的值代表较大的相似性），可以节省低分第X号。
由用户产生的数据文件，必须用逗号分隔文本文件。每个文件都代表一个独特的分子。在一个文件中的每一行代表该分子的一个独特的构象。数据文件中的第一列必须是唯一的，以由行表示的构象的标签。列的其余的数字描述符，如距离空间的测量。
这些行被组合地文件之间进行比较。在比较标签被级联和保存的分数的组行。这提供了一种方法，以确定其产生一个给定的相似性得分的构象。
今后的工作包括：
- 在加入GUI界面
- 在我的3D药效建模算法发布文件
- 在使用MPI并行版本
什么在此版本中是新的：
- 修正了几个小编译器警告
- 添加了报告的计算时间，除了此前报道的排序时间设定组合计算
- 二进制 增加编译器优化级别
要求：
的Mac OS X 10.3
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