最好的软件为 American Museum of Natural History

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POY 4.1.2

POY是支持多个类型的数据（例如形态学，核苷酸，基因和基因区域，染色体，和全基因组）的系统发育分析程序。...

10 Jul 15 在教育和科学软件, 族谱软件

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Malign 2.8

在恶性实现的多序列比对程序接近平行那些用来搜索最小长度cladograms。逻辑和程序命令会清楚那些熟悉诸如Hennig86，NONA和PAUP程序。对准拓扑是通过不同的序列构建，并通过分支交换改进。每个对准拓扑产生多重比对和cladograms从该路线的构建。最简约的进化树的费用，然后分配为多重比对的成本。...

27 May 15 在教育和科学软件, 学软件

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