AREM

AREM 1.0.1

AREM是一款基于MACS(基于模型分析的ChIP-SEQ数据)。高通量测序耦合到染色质免疫沉淀(芯片起)被广泛用于表征基因组范围的转录因子,辅因子,染色质改性剂,和其它DNA结合蛋白结合模式。在芯片起数据分析的一个关键步骤是由映射高通量测序短读取到参考基因组,并确定富含短读取峰值区域。虽然有几种方法已经被提出用于芯片起分析,大部分现有ACTUAL方法仅考虑读取,可以唯一地放置在参照基因组,并因此具有低的功率,用于检测峰值LO-重复序列内cated。在这里,我们介绍一种概率进近的芯片起的数据分析,利用所有的...