必须有 软件 为 Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan

全基因组表达谱提供了不同条件下的细胞的全局状态的快照。然而，mRNA水平不提供直接的了解上游监管机制。 Expression2Kinases（X2K）是一种新的方法来确定上游监管机构可能负责在全基因组基因表达观测到的变化。通过集成芯片起/芯片及位置重矩阵器（PWM）数据，蛋白质 - 蛋白质相互作用，并且激酶底物磷酸化反应X2K可用于识别调节机制中的基因表达的全基因组差异上游。我们的想法是第一推断调节基因表达的差异的最可能的转录因子，然后使用蛋白 -...

GATE（时间序列的表达的电网分析）是用于高维生物分子的时间序列的分析和可视化的综合计算软件平台。门使用基于相关的聚类算法根据分子组分的表达水平，安排分子的时间序列上的两维六边形阵列和动态颜色各六角形它们所分配的，以创建的系统级的分子动画电影监管力度。以此来推断从相关模式的潜在监管机制，GATE还允许电影对各种先验知识数据集的互动审讯。 GATE电影可以暂停，是互动，让用户重建网络，并进行功能富集分析。与GATE制作的电影可以保存在Flash格式，并直接插入到PDF文件手稿互动数字 ...

Genes2Networks是一个命令行软件工具，可以用来放置在一个背景哺乳动物signalome和相互作用组网络的上下文哺乳动物基因的列表。 输入到程序是人的列表Entrez基因基因符号和SIG格式背景网络，而所述输出包括：用于基因/蛋白质的所有鉴定的相互作用，子网使用用于连接的基因中间部件连接的基因/蛋白质，中间组件的特异性的排名，就可以与基因/蛋白质的列表，并从种子列表的基因/蛋白质的基础上从彼此在网络空间中的距离的聚类分析交互 要求： 在DOS，Windows 3.X / 95/98 / ME...

研究出版物的量，每天加在考研人的知识基础是压倒性的。保持最新状态与最新的研究是科学家成功的关键。 PubMedAlertMe可以帮助用户随时掌握最新与自己喜爱的考研查询。该项目计划运行每天或每周一次。 如果该程序的搜索引擎搜索张贴在考研最新发表的论文，它发送带有链接到新的文件清单一封电子邮件，链接到引文导出到尾注和链接转发文章同事。第2版​​增加出口引到EndNote，电子邮件文章给朋友，和固定的HTML输出 是什么在此版本中是新的：...

查看的蛋白质 - 蛋白质和配体 - 蛋白质相互作用的曲线图（网络），其中的生物分子被表示为节点和它们之间的相互作用被表示为链路，是一种有前途的方法用于集成不同来源的实验结果来实现的分子机制系统了解驾驶细胞表型。大规模的信令网络的出现提供了一种拓扑统计分析的机会，而这种网络的可视化提出了挑战。 SAVI实现标准方法来计算聚类，连接分布和检测，以及可视化，网络图案。此外，SAVI产生的网络数据集以文本格式完整的网站。...