edittag

edittag是一个应用集设计集编辑度量序列标签，检查序列标签对构象到编辑度量，和整合序列标签对特定平台的测序接头和PCR引物。 edittag不同于其他的方法：
＆NBSP; * edittag生成编辑度量序列标签使用多合理的时间框架任意长度
＆NBSP; * edittag产生编辑度量序列标签集符合所选择的编辑距离
＆NBSP; *使用edittag：引物进行整合序列标签PCR引物
我们提供了多种大型成套编辑指标序列标签以下格式使用edittag设计的：
＆NBSP; *文本 - 该文件是为check_levenshtien_distance.py适当的格式
＆NBSP; * csv格式
＆NBSP; * SQLite数据库
引用
费尔克洛思BC，格伦TC。大型成套编辑度量序列识别
标签以方便大型多路复用读取来自大量
平行测序。 doi_
安装：
easy_install的
easy_install的edittag
tar.gz的
wget的package.tar.gz
焦油-xzf package.tar.gz
蟒蛇setup.py安装
知识库
混帐混帐克隆：//github.com/baddna/edittag.git edittag
可选包（PY-莱文斯坦）
wget的http://pylevenshtein.googlecode.com/files/python-Levenshtein-0.10.1.tar.bz2
焦油-xzvf蟒蛇 - 莱文斯坦 - 0.10.1.tar.bz2
蟒蛇setup.py安装
可选包（引物3）
如果你想设计引物结合编辑指标序列标签，你需要首先安装：引物的修改版本：
混帐混帐克隆：//github.com/baddna/mod-primer3.git
CD MOD-引物3 / src目录
使
使安装
确保您的移动MOD-引物3二进制文件到您的路径位置（移动至少引物3，长primer3_config到您的路径相同的目录）。然后，您可以运行

要求：

• 在Python中
• 在NumPy的
• 在莱文斯坦
• 在MOD-引物3