Pathomx

Pathomx（原MetaPath）在IPython中，Qt和PyQt的实施一个开源的图形化软件，从设计来充当可视化和在GNU / Linux和其他POSIX＆NBSP代谢分析数据的交互式工具;工作系统。它最初设计用于在glanceKey处理功能代谢data.Features包括导入和导出NMR（核磁共振）的数据，光谱处理，包括标准化，分级和校准，以及代谢途径可视化和矿业的支持。您也可以通过各种途径进行可视化导入指定通路基因组和代谢组学数据。
各种MetaCyc数据库注解也被包括在该Pathomx应用，其中我们可以提到数据库统一链接，同义词，以及相关的途径和反应。请注意，MetaCyc数据库从公共API而得。
该应用程序使用迅速地探索复杂的数据集，由于可扩展和可配置的插件，功能强大的MetaCyc数据库。另外，它采用了numpy的和SciPy的库数量处理，Matplotlib的图形，nmrglue核磁共振数据导入，d3.js交互式图表和scikit学习的统计分析methods.Under引擎盖和支持OSesLooking的引擎盖下Pathomx，我们可以看到该应用程序已建成IPython的命令shell。它还在Microsoft Windows和Mac OS X操作系统中，它是可供下载的预编译的二进制包效果很好。为GNU / Linux，软件分发只能作为gzip压缩的源代码文件与32位和64位硬件平台兼容。
当使用Pathomx，用户应记住，在应用程序使用的数据来自MetaCyc途径数据库本身，这是BioCyc家庭的一部分。该MetaCyc API用于生成提供的数据库，这是本地存储

什么在此版本中是新的：

• 一个全新的拖放可视化编辑器增加了。
• 在它允许您通过拖动工具到工作区中，通过拖放工具之间的数据线连接的编辑，并使用内嵌视图得到当前处理的概述创建分析工作流程。
• 数据可以被丢弃到工作区即时导入。
• 这也增加了现场每个工具进度的通知，酒吧和状态指示灯。
• 在错误标记有帮助文本（如果显示在工具提示红色）。

要求：

• 在Graphviz的