E-Cell System

E-Cell系统是在计算机上虚拟构造单元的概念。
E-Cell系统是一个面向对象的软件套件进行建模，仿真和大型复杂的系统，如生物细胞，经高桥耕一架构，并通过编写一个美妙的开发团队分析。系统，E-Cell模拟环境版本3，核心部分允许具有不同时间尺度的共存受到多个算法许多组件。
电子电池项目是一个国际研究项目旨在开发必要的理论支持，技术和软件平台，允许精确的全细胞模拟。
E-Cell系统由以下三个主要部分组成：
- E-Cell模拟环境（或E-Cell SE）
- E-Cell模拟环境（或E-CELL ME）
- E-Cell分析工具包

功能：

<李班=“bbli”>基本功能：
• 在面向对象的建模和仿真复杂系统。
• 插件架构。新的用户对象类可以开发，动态加载，并在模拟中使用。

在模拟过程中
• 实时用户交互和可视化。

<李班=“bbli”>脚本：
• 模拟会话的Python脚本（启动/停止/参数操作/数据处理等）。
• 的模拟实验，涉及的模拟会议多次运行Python脚本（如参数调整，代谢控制分析等）
• 在模型文件生成的Python脚本（如从数据库中自动模型建设）。

<李班=“bbli”>兼容性：
• 在SBML水平1/2进口。
• 在SBML水平1/2的出口。

<李班=“bbli”>并行计算：
• 共享内存，单个模拟会话的多线程并行化。 （要合并到主分支。）
• 集群和网格的分布式多模拟会话计算。 Sun Grid Engine的，（Globus的工具包）。

什么在此版本中是新的：

• 在这个版本增加了各种错误修正

什么是新的版本3.1.107 RC2：

• 修正了一个在ecell.Session.saveLoggerData错误（）。 （森吉）
• 修正了ecell.ECDDataFile的错误。 （森吉）

什么是版本3.1.107 RC1新：

• 在固定编制的新的海湾合作​​委员会（GT的问题; = 4.3）。 （森吉）
• 集成到pyecs pyecell。 （森吉）
• 在合并ecell.emc到ecell.ecs，以避免在某些平台上（包括Mac OS X）静态初始化的怪事。 （森吉）
• 在两个GUI前端（会话监控和模型编辑器）被重新成为Python模块，ecell.ui.osogo和ecell.ui.model_editor两个包。 （森吉）
• 感动GtkSessionMonitor到ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor驻留在ecell /前端/ SESSION_MANAGER。 （森吉）
• 更名为ecell.SessionManager ecell.session_manager。 （森吉）
• 删除从ecell.ecs_constants以下常量。 （森吉）