Staden Package

施塔登包是一个全面发展的一套DNA序列组装（Gap4），编辑和分析工具（旋转）为Unix，Linux和MacOSX上和MS Windows的。
在Gap4面前出现了几次小的加入相关
改进如何得分加盟查找内部联接和
在加入编辑器中的对齐按钮的功能。
还后果gap4的是各种变化io_lib（该
库所有I / O，以各种跟踪文件格式）。通过加入
新hash_exp程序现在允许实验文件是
连接到一起，并​​建立索引。实验的文件名列表
应STIL提供给gap4，但所提供的EXP_PATH环境
变量已经被正确设置gap4就能取个人
序列出级联实验文件
存档。改进的用户界面，这仍然需要
制作。
454 SFF档案现在更好的支持。该defsult 454指数
现在的工作，虽然hash_sff程序可以被用来提供一个
另一种索引策略（可能快于某些情况下）。
Gap4和崔佛也有另外的痕迹跟踪显示风格，
每次有电话基地1个样品扫描（4个通道）。在这种情况下，可以
也借鉴4置信度值，而不是1元的基础。这些能力
将能更好地整合的Solexa的痕迹时，更容易
可用。
另外，当然bug修复和小的调整通常的组合。见
完全更改日志详细信息（通过SourceForge的网站）。
其他显着的变化
Gap4