CaPSID

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CaPSID
软件详细信息:
版本: 1.4.3
上传日期: 20 Feb 15
开发: Shane Wilson
许可: 免费
人气: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

衣壳是一个全面的开源平台,它集成了高性能计算管道病原体序列识别 与表征人类基因组和转录组以及一个可伸缩的结果数据库,用于管理用户友好的基于Web的软件应用程序,查询和可视化效果。
入门
您将需要MongoDB数据库,一个Python 2.6+的安装和Apache Tomcat 6+。欲了解更多详情,请阅读维基:

  • 在修复:http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

    What在此版本中是新的没有找到运行减法和调整时的错误消息

  • 在固定长时间运行的查询更多的工作

什么是1.4.2版本,新的

  • 在删除MongoKit依赖

什么是1.4.1版本,新的

  • 在修复光标超时长时间运行的查询统计

什么是1.4.0版本,新的

  • 在,而他们正在运行,而不是一切都增加统计在结束
  • 在保存的唯一ID的基因,UID

什么在1.2.7版本新

  • 在修复README

什么是1.2.6版本,新的

  • 在减法过滤掉映射的建筑映射在读

什么版本1.2是新的

  • 在实用程序来创建FASTQ文件从映射的阅读
  • 在实用程序返回FASTQ文件交叉口
  • 在实用返回过滤FASTQ文件
  • 添加mapq门槛标志减法
  • 在Gbloader现在可以装载细菌和真菌的基因组
  • 在保存使用GridFS的基因组序列数据库
  • 在减少内存占用量计算统计数据时,
  • 使用子过程,而不是使用os.system
  • 在mapq分数滤波器需要包括0

什么是1.1版本,新的

  • 在增加了对终端的支持读取

什么在1.0.1版本新

  • 在添加了对MongoDB的认证支持

要求

  • 在Python中

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