Gmatch

Gmatch 0.1.0

Gmatch是用于使用Groth的方法相匹配的目录的工具。样品使用 从>>>进口gmatch gmatch  >>>#负载从某处CAT1和CAT2  >>>#他们numpy的数组  >>>#N行,2列  >>> cat1.shape (20,2)  >>> cat2.shape (20,2)  >>>匹配= gmatch(CAT1,CAT2,EPS = 1E-3) ...

ANTz

ANTz 2012_04_11

ANTZ是一个互动的实时三维数据可视化软件的复杂系统的认识。把它看成是“电子表格满足网络空间。”身临其境的多维空间为基础的环境,实时分析和决策。能够存储的数据与源活时间敏感的情况下结合。这是件好事寻找谚语“大海捞针”。视觉环境使得更有效的机制,以确定的模式和关系。数据字段映射到参数如几何形状,透明性,速度和位置。基于形状,颜色,大小和质地的空间提示使用户能够识别关键图案。最终的目标是关闭的用户和被称为计算机强大的逻辑引擎之间的认知循环...

SSuMMo

SSuMMo 0.3

SSuMMo是功能设计围绕反复使用HMMER以序列分配到类群&NBSP库;结果在很大程度上注明树显示,社区内的物种/属分布。包含源代码程序,包括工具: - - 建立隐马尔可夫模型的层次数据库 - dictify.py; - 分配序列公认的分类名称 - SSUMMO.py; - 分析生物多样性,采用辛普森,香农与其他方法 - rankAbundance.py; - 可视化结果带有明显的能力,很容易交叉对比数据集进化树 - comparative_results.py -...

挖洞轮车定位仪(BWA)是对齐针对长期参考序列比较短的碱基序列,例如,人类基因组的高效程序。该软件实现了两个算法,BWA-短期和BWA-SW。前者作品查询序列比200bp的短,达到约100kbp后者为更长的序列。两种算法做跳空对齐。它们通常更精确和更快的具有低错误率的查询。请参阅BWA手册页了解更多信息。 BWA是否对齐454读取? 是的,没有。 BWA的BWA-SW部分运作良好,在454读取约200个基点以上。它实现了类似的对准精度来SSAHA2而快得多。...

poppy

poppy 0.2.8

罂粟是实现一个面向对象的系统建模物理光学与衍射传播,特别是对于伸缩和日冕成像的多波长模拟一个Python模块。眼下唯一的远场衍射图像和瞳孔平面之间(弗劳恩霍夫政权)的支持;菲涅尔传播和中间平面是一个未来的目标。在STScI的,2010-2012年开发的马歇尔佩兰,用于模拟詹姆斯·韦伯太空望远镜。文档可以在网上找到http://www.stsci.edu/jwst/software/webbpsf/Requirements:Python...

模糊集阿达是一个库,提供与操作置信因子的实现不是,与,或,异或,+和*,古典模糊集与集合论操作和可能性理论的操作,直觉模糊设置与对他们的业务,基于模糊逻辑的直觉模糊集和可能性理论;模糊数,整数和浮点与传统的算术运算,以及语言变量和集合与他们的操作语言变量。模糊集阿达具有面向字符串的I / O支持 功能: 在信心因素与不操作,和,或,异或,+,*; 经典模糊集与集合论操作和可能性理论的操作; 直觉模糊集与他们的操作; 基于直觉模糊集和可能性理论模糊逻辑; 模糊数整数和浮点那些与传统的算术运算;...

GeoAlchemy

GeoAlchemy 0.7.2

GeoAlchem​​y是SQLAlchem​​y的扩展,提供了在ORM层使用SQLAlchem​​y的地理空间数据类型的支持。它的目的是支持开放地理空间联盟(OGC)指定的空间操作和关系。安装方式:安装类型像往常一样:easy_install的GeoAlchem​​y或者,下载包,变成geoalchem​​y目录,然后键入:蟒蛇setup.py安装 要求: ...