Orthanc

Orthanc 0.9.1 更新

Orthanc是一个完全免费的，开源的，简单，重量轻，但功能强大的REST风格的独立DICOM（医学数字成像和通信医学）服务器，可以在医疗保健和医学研究的环境中使用。这和rsquo的;用C...

18 Jul 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
Murka

Murka 1.4.1 更新

Murka是一个免费，跨平台和开源的命令行软件，可帮助用户轻松解决系统发育问题，只需使用平均网络。它包括启发式方法，精确的算法，以及一个施泰纳问题解决者。Murka大局;输入提供可逆和取向stepmatrix，输出报价（分）最佳树和它们的几种组合。该软件已在Linux和Microsoft Windows操作系统进行了测试。本申请提供的最低费用树的完全覆盖。有几个类似的计划存在，如AWC...

14 Apr 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
MACS2

MACS2 2.0.10.20130731

MACS2是基于模型的分析工具的ChIP-SEQ数据。用的测序技术的改善，染色质免疫沉淀，随后通过高通量测序（芯片起）越来越流行，研究的全基因组蛋白-DNA相互作用。为了解决缺乏强大的芯片序列分析方法，提出了一种新的算法，命名为芯片-SEQ（MACS）基于模型的分析，确定谈话因子结合位点。 MACS捕获的基因组的复杂性，以评估富集芯片区域的意义的影响，和MACS提高了通过结合两种测序标签的位置和方向的信息的结合位点的空间分辨率。 。MACS可以很容易地用于芯片序列数据单独或与具有特异性的增加控制样品 ...

20 Feb 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
misopy

misopy 0.4.9

MISO（异构体的混合物）是用Python编写的概率框架，进行定量的表达水平与NBSP;从RNA测序数据的选择性剪接基因，并确定整个样本差异调节亚型或外显子。通过模拟的生成过程，其中读取来自于RNA测序亚型的生产，从MISO模型使用贝叶斯推断来计算该读出来自一个特定同种型的概率。MISO使用的读操作亚型定量底层一套替代mRNA异构体的丰度的推断分配。置信区间过度估计可以得到的，其量化所述估计值的可靠性。请参阅http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/的MISO手动和文档...

20 Feb 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
CaPSID

CaPSID 1.4.3

衣壳是一个全面的开源平台，它集成了高性能计算管道病原体序列识别＆NBSP;与表征人类基因组和转录组以及一个可伸缩的结果数据库，用于管理用户友好的基于Web的软件应用程序，查询和可视化效果。入门您将需要MongoDB数据库，一个Python 2.6+的安装和Apache Tomcat 6+。欲了解更多详情，请阅读维基： 在修复：http://wiki.github.com/capsid/capsid/homeWhat在此版本中是新的没有找到运行减法和调整时的错误消息在固定长时间运行的查询更多的工作 ...

20 Feb 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
Genepidgin

Genepidgin 1.1.1

Genepidgin是一套Python的工具，协助评估和分配基因产品名称及NBSP;有三个主要组成部分：genepidgin *清洁*＆NBSP;规范了每UNIPROT命名规则基因名称genepidgin *比较*＆NBSP;比较两个或更多组基因名称的genepidgin *选择*＆NBSP;从同源性证据vareity选择最适当的产品名欲了解更多信息，包括当前的发展状况，请访问Genepidgin的文档 要求： ...

20 Feb 15 在 教育和科学软件, 生物信息学
Linux
阅读更多
按类别搜索
热门软件