免费 生物信息学 为 Linux

在STEME项目开始生活作为一个近似的预期，Maximisation算法的图案发现者，如MEME使用模型的类型。STEME大局; EM近似运行一个数量级比更迅速的MEME实施为典型的参数设置。 STEME现已发展成为在自己的权利一个不折不扣的图案发现者。为什么要使用STEME？成熟的模式发现技术STEME是基于尝试和测试MEME算法。...

Geant4的项目是一个工具包，颗粒通过物质的通道的模拟。其应用领域包括高能物理和核实验，医疗，加速器和空间物理学研究 什么在此版本中是新的： 在使用贝尔蒂尼级联伽玛核互动的新模式加入。的贝尔蒂尼模型PI-，K-，以及用于在休息核捕获的Sigma-被引入，随着WentzelVI模型多次散射E...

构建类似​​于make系统经常用于创建复杂的工作流程，如在生物信息学和NBSP; snakemake旨在通过提供一个干净的和现代的特定领域的规范语言（DSL）在python风格使创建工作流程的复杂性，以及快速，舒适的运行环境。安装 - 在Ubuntu 12.04中，可以安装Debian软件包python3-snakemake可在我们启动板库。 - 在其他系统上，你需要的Python> = 3.2的安装工作。根据您的系统，您可以通过发出任何的easy_install...

reciprocal_smallest_distance是使用全局序列比对和序列之间的最大似然进化距离准确地检测基因组之间的同源基因成对直向算法。安装从压缩包下载并解压最新版本github上：CD〜卷曲-L https://github.com/downloads/todddeluca/reciprocal_smallest_distance/reciprocal_smallest_distance-VERSION.tar.gz...

seriesoftubes是一个扩展的管道的Solexa芯片起的数据。包文件 要求...

VULCAN项目提供计算流体动力学分析。VULCAN（粘性迎风算法的复杂流量分析）提供了亚音速计算流体动力学通过高超声速湍流反应和对各种串行和并行计算平台的非反应流。推进流分析的计算成本是通过使用特殊的紊流壁处理，多网格方法椭圆和空间推进计划减小，并且方程的调理，以减少数值刚度。物理建模能力通过纳入模型压缩，雷诺应力各向异性，湍流扩散，有限率化学，湍流/化学反应相互作用效果的提高。VULCAN可以模拟二维，三维，或轴对称多块的问题 什么在此版本中是新的： ...

edittag是一个应用集设计集编辑度量序列标签，检查序列标签对构象到编辑度量，和整合序列标签对特定平台的测序接头和PCR引物。 edittag不同于其他的方法：＆NBSP; * edittag生成编辑度量序列标签使用多合理的时间框架任意长度＆NBSP; * edittag产生编辑度量序列标签集符合所选择的编辑距离＆NBSP; *使用edittag：引物进行整合序列标签PCR引物我们提供了多种大型成套编辑指标序列标签以下格式使用edittag设计的：＆NBSP; *文本 -...

橙生物信息学是一个橙色的数据挖掘软件附加＆NBSP;它扩展橙在生物信息学的基本任务提供常用功能。它还提供了小部件橙色帆布，使用户谁是不是程序员来管理芯片和基因组数据流量和通过结合常见的数据分析工具，以满足他们的需求来定制他们的分析。文档被找到在：http://orange-bioinformatics.readthedocs.org/Requirements:Python...

HTSeq是一个Python框架来处理和分析来自高通量测序数据（HTS）测定 要求： <...

avalanchetoolbox是一个工具箱，用于识别和描述分支过程，如神经元雪崩 要求： ...