CodonW

CodonW是旨在简化密码子和氨基酸的使用多因素分析（对应分析）的程序。它还计算密码子使用的标准指标。它有两个菜单和命令行界面。
该CodonW项目在保锐，遗传学系，英国诺丁汉大学的实验室写由约翰·佩登。约翰是工作在人类遗传学和目前受聘为ProCardis数据库管理器在WTCHG在牛津大学。
这里是“CodonW”的一些主要特点：
·用ANSI标准的C
·菜单驱动
·命令行选项广泛号
·独立的遗传密码
·上没有限制
1.数字序列
2.序列长度
·计算的密码子使用指数
1.蔡：密码子适应指数
2. Fop的：优化密码子频率
3. NC：密码子的有效数量
4. CBI：密码子使用偏好指数
·计算氨基酸指数
1. GRAVY得分
2.芳香
·计算的对应分析
1.密码子使用
2. RSCU（相对同义密码子使用）
3.氨基酸的使用
·对应分析
1.可以包含/排除密码子/氨基酸
2.可以生成趋势的详细报告
3.尝试自动确定最佳的密码子
4.可以允许额外的数据集被添加
5.记录任何数量的趋势
·计算参数基因
1基因的长度
2. GC，GC3s和密码子位置的特定G + C
3.二核苷酸的组合物（在所有三个密码子帧）
4.氨基酸用法
5.相对氨基酸用法
6.密码子使用
7.相对同义密码子使用
·在概念转换序列的蛋白质
·重新格式化序列数据
·人力或机器可读的输出
·可以连接基因（同时保留阅读框）来计算
1.整体密码子使用
2. GC含量
3.二核苷酸组成
·生成密码子表，氨基酸，或RSCU用法
·甚至可以帮助你学习的遗传密码。
·多