BioRuby

BioRuby 1.5.0 更新

BioRuby提供了生物信息学的集成环境(生物信息学)。面向对象的脚本语言Ruby有许多功能,适用于生物信息学研究,例如,清楚的语法来表达复杂的对象,对于文本处理正则表达式一样强大的Perl的大局;,各种各样的图书馆,包括Web服务等。由于Ruby的语法很简单,很干净,我们认为这是简单易学,适合初学者,易于使用的生物学家,也是足够强大的软件开发人员。在BioRuby,开发人员可以检索平面文件,互联网Web服务器和本地关系型数据库的生物资料库的条目。这些数据库条目可以被解析以提取所需的信息。生物序列可以用红宝...

jQuery的结合可以让开发人员在JavaScript对象执行像工会,交,差和对称差操作。这意味着复杂的JavaScript阵列可以添加或相交为使用在高级数学计算。【举例和使用说明都包含在下载包 要求: 在客户端中启用JavaScript...

Finance.js是做,而不是发送数据给服务器,并等待响应所有的在客户端金融计算的,一个非常有用的库。它可以处理大量的操作,从简单的数学加法到更复杂的摊还。图书馆自动化的各种财务计算,并让开发商指定简单的参数,并得到各知名金融公式,费率和时间表的结果。示例和使用说明都包含在Finance.js下载包 功能: 在可自动格式化数字字符串可自动格式化字符串货币可自动格式化百分比能处理的货币指标可以计算:在贷款支付金额资助金额资助几个月利率应计利息分期付款计划 要求: ...

Gato

Gato 1.1.2

图是连接顶点对数学对象,包括顶点和边:认为城市为顶点和州际公路的边缘连接两个城市。算法可能发现的最短路径 - 最快的路线 - 或者最小生成树或解决在图形上其他有趣的问题之一:最大流量,权重和非权重匹配和最小费用流。可视化装置连接的原因 - 一种算法的发言 - 立即的效果 - 变化的曲线,该算法具有作为其输入 -...

Topographica

Topographica 0.9.7a

Topographica是一个软件包,用于神经地图的计算模型。目的是帮助科学家理解大脑功能的组成感觉和运动系统地形图的水平。Topographica旨在补充了许多很好的低级别的神经元模拟器可用,如创世纪和神经元。这些模拟​​器专注于模拟神经元,其中小型网络的详细内部行为。Topographica代替集中于大型的结构和功能是可见只有当成千上万这样的神经元被连接到含有百万连接地形图。许多重要的现象无法加以研究没有这种大的网络,包括两维视觉方向和运动方向的地图,和对象分割和分组处理的组织。为了使这样的模型实用,在...

KEGG2SBML

KEGG2SBML 1.5.0

的系统生物学标记语言(SBML)是基于XML的描述语言表示计算模型在系统生物学和生物信息学。KEGG2SBML的功能目前仅限于只转换KEGG代谢途径的文件,而不是其他类型的KEGG文件。KEGG2SBML可以转换KEGG通路数据库版本46.0或更高版本。 (过去KEGG通路数据库的版本都没有经过测试,可能不会被KEGG2SBML进行转换。)它可以产生SBML Level 1和Level 2(第1版),有或没有不标注使用CellDesigner和SBML 2级版本2级和2级第3版的注解。 ...

GMOD

GMOD 1.69

GMOD是通用模式生物数据库项目,开源软件工具,用于创建和管理基因组范围内的生物数据库集合。这样的数据库包含的基因组和生物实验室生物学信息。它可以用来创建基因组注释的小型实验室数据库,或一个较大的web可访问社区数据库。这个应用程序是用Java,C...