最好的 生物信息学 为 Linux

E-Cell系统是在计算机上虚拟构造单元的概念。E-Cell系统是一个面向对象的软件套件进行建模，仿真和大型复杂的系统，如生物细胞，经高桥耕一架构，并通过编写一个美妙的开发团队分析。系统，E-Cell模拟环境版本3，核心部分允许具有不同时间尺度的共存受到多个算法许多组件。电子电池项目是一个国际研究项目旨在开发必要的理论支持，技术和软件平台，允许精确的全细胞模拟。E-Cell系统由以下三个主要部分组成： - E-Cell模拟环境（或E-Cell SE） - E-Cell模拟环境（或E-CELL ME）...

NEO（神经合奏的对象），是一个项目，提供一套通用的基类神经的数据分析中使用，以获得OpenElectrophy，NeuroTools或许其他项目有类似目标的更紧密的目的。两个主要的目标已经确定，到目前为止：＆NBSP; *第一个里程碑是提供一种用于处理电生理（体内和/或模拟的）数据定义通用类名和概念。＆NBSP; *第二个里程碑是重新实现这些抽象类，因为这会满足两个项目的模块。该项目背后的人来讨论非常开放。任何反馈是很高兴的欢迎和高度赞赏 要求： ...

OpenElectrophy是一个框架，以方便操作，存储和电生理数据进行分析。它可以从许多不同的文件格式导入数据，并将它们存储在单个SQL型数据库。包括OpenELectrophy分析工具振荡检测和穗检测。进一步的分析必须被写入但OpenElectrophy提供类和函数的库，它的高度有利于在数据库和其操作有用的数据的查询。 。提供的脚本示例的完整列表，并且可以简单地修改，以适应任何具体数据，需要 要求： ...

tigreBrowser是从蒂格雷 - [R包结果的基因表达模式浏览器（http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html）。安装：tigreBrowser需要Python版本> = 2.5。...

avalanchetoolbox是一个工具箱，用于识别和描述分支过程，如神经元雪崩 要求： ...

checkmyclones是一种软件，它提供工具来检查桑格测序结果＆NBSP;（或任何纯文本或FASTQ文件）对一组参考序列，在任何合理的格式（包括坐标）提供 要求： ...

CWC模拟器是一个C ++实现化学武器公约，一个微积分的代表性和模拟生物系统＆NBSP的;安装成功后（请参阅安装），你就可以运行模拟了CWC机型，如在一些实例（见例子/）。（命令行）界面作为一个普通的用户，你应该运行：-i model.cwc-o -t -s -n -c --qt阈值-q -w 其中： - 是可执行文件的名称（默认：SCWC）;＆NBSP; - model.cwc是输入CWC程序（见例子）;＆NBSP; - 统计数据是输出文件的前缀;＆NBSP; - ...

貘是一个Python的工具，它包含程序估算并绘制系统发育信息量用于大型数据集。引用貘当使用貘，请引用： - 公元前费尔克洛思，长安Ĵ，阿尔法罗ME：貘使系统发生信息量的高通量分析。 - 汤森JP：仿形系统发育信息量。系统生物学。 2007年，56：222-231。 - 池塘SLK，弗罗斯特SDW，缪斯SV：的HyPHY：假设使用系统发育测试。生物信息学2005，21：676-679。安装目前，安装程序最简单的方法是：混帐混帐克隆：//github.com/faircloth-lab/tapir.git...

橙生物信息学是一个橙色的数据挖掘软件附加＆NBSP;它扩展橙在生物信息学的基本任务提供常用功能。它还提供了小部件橙色帆布，使用户谁是不是程序员来管理芯片和基因组数据流量和通过结合常见的数据分析工具，以满足他们的需求来定制他们的分析。文档被找到在：http://orange-bioinformatics.readthedocs.org/Requirements:Python...