最好的 生物信息学 为 Linux

picme是包含项目估算并绘制系统发育信息量用于大型数据集Python包。安装目前，安装程序最简单的方法是：混帐混帐克隆：//github.com/faircloth-lab/picme.git /路径/到/ picme运行测试：CD /路径/到/ picme /蟒蛇测试/...

Pathomx（原MetaPath）在IPython中，Qt和PyQt的实施一个开源的图形化软件，从设计来充当可视化和在GNU /...

Ghemical是在GNU GPL下发布的计算化学软件。这意味着，包完整的源代码可用，并且用户可以自由地研究和修改程序包。 Ghemical是用C ++编写。Ghemical项目具有图形用户界面（这是基于GNOME），并且支持量子力学（半经验和从头）模型和分子力学模型（还有一个实验荣誉学位5.2样力场有机molecu也为减少蛋白质的模型[1]的一个工具是包括在内。几何优化，分子动力学和一大组的可视化工具目前已经上市。Ghemical依靠外部码以提供量子力学计算。半经验方法MNDO，MINDO /...

LSim叠加大分子电子密度和计算的结构相似性得分。其计算线性扩展与分子的大小进行比较。的LSim路线在概念上是无关的生化结构元件，因此，是无偏和适当的用于结构只蛋白相似的研究。安装方式：解压缩分发文件：焦油-xzvf lsim-linux.tar.gz移动到文件目录：CD lsim.1.0.0复制，移动或可执行文件lsim链接到一个合适的位置 - 和确保lsim是通过PATH环境可变，例如访问：CP lsim的/ usr / local /...

ProteinShop是用于操纵蛋白质结构的交互式工具。它被设计用来快速创建使用人类的知识和直觉一组蛋白质配置。这些配置可以进行局部或全局优化。虽然ProteinShop不进行全局优化过程本身，它提供了一个框架可用于与一个全局优化过程互动这可能是一个远程计算机上运行。ProteinShop提出了三种级别的功能Ⅰ级：显示一个三维的蛋白质结构...

Syntainia是一个创新的应用为多个基因组的可视化及NBSP;它提供了一个简单而直观的用户界面来查看和操纵基因组之间的关系。更清晰的基因的可视化，它是更容易为研究者以识别多个基因组中同线性保护。  Syntainia是一个桌面应用程序，它看起来不错，在Windows，Linux和Mac OS X上运行流畅，而且也适用于任何其他操作系统与Java 6。 什么是新的的此版本： ...

泥炭是一套用于捕获，预测和分析蛋白质的生物物理特性的方案。见http://enzyme.ucd.ie/PEAT的文档，说明，截图等 要求： ...

edittag是一个应用集设计集编辑度量序列标签，检查序列标签对构象到编辑度量，和整合序列标签对特定平台的测序接头和PCR引物。 edittag不同于其他的方法：＆NBSP; * edittag生成编辑度量序列标签使用多合理的时间框架任意长度＆NBSP; * edittag产生编辑度量序列标签集符合所选择的编辑距离＆NBSP; *使用edittag：引物进行整合序列标签PCR引物我们提供了多种大型成套编辑指标序列标签以下格式使用edittag设计的：＆NBSP; *文本 -...

reciprocal_smallest_distance是使用全局序列比对和序列之间的最大似然进化距离准确地检测基因组之间的同源基因成对直向算法。安装从压缩包下载并解压最新版本github上：CD〜卷曲-L https://github.com/downloads/todddeluca/reciprocal_smallest_distance/reciprocal_smallest_distance-VERSION.tar.gz...

构建类似​​于make系统经常用于创建复杂的工作流程，如在生物信息学和NBSP; snakemake旨在通过提供一个干净的和现代的特定领域的规范语言（DSL）在python风格使创建工作流程的复杂性，以及快速，舒适的运行环境。安装 - 在Ubuntu 12.04中，可以安装Debian软件包python3-snakemake可在我们启动板库。 - 在其他系统上，你需要的Python> = 3.2的安装工作。根据您的系统，您可以通过发出任何的easy_install...